Co-Expression Analysis of: CYP78A7 (At5g09970) Institut de Biologie Moléculaire des Plantes











































































































































_____________________________________________
____________________________________ ____________________________________ ____________________________________ ____________________________________ ____________________________________ ____________________________________ ____________________________________ ____________________________________

________________________ _____________________________________________ CYPedia Home






















































































































































Mutant Data Set save / view heatmap as: OpenOffice Table annotation details for co-expressed genes can be found to the right of the heatmap

























































































































































MS Excel Table

























































































































































save / view all data as: Tab delimited Table For further information on the experiments please go to the Genevestigator database using the experiment-ID given in brackets.






















































































































































shown are a maximum of 50 genes with r>0.5 (If more co-expressed genes with r>0.5 exist, they can be saved as Tab delimited data only) magnitude of change  [log2(mutant / wild type)]  0   0.3   0.6   0.9  1.2   1.5   1.8   2.1   2.4   2.7   >3















































































































































greater than zero                                                         



















































































































































less than zero                                                         



















































































































































Locus r-value Name Description 35S leafy, seedling (143) aba1, fresh seeds (96) abi1, fresh seeds (96) abi3, fresh seeds (96) acn1, seedlings (63) acn1, seedlings, with sucrose (63) add3, seedling (55) ag12, shoot apex (89) ag12, flower (89) akt1, roots (141) anr1, roots, dex treated, N03 depleted (64) anr1, roots, not dex treated, N03 depleted (64) anr1, roots, nitrate depleted (135) ap1, shoot apex (89) ap1, flower (89) ap2, shoot apex (89) ap2, flower (89) ap3, shoot apex (89) ap3, flower (89) ape2, mature leaf, high light (68) ape3, mature leaf, low light (68) ARR22o, seedling (115) ARR22o, seedling, zeatin (115) ar4, whole plant (104) bountifullo, juvenile leaf (48) camta1, suspension cell (138) camta1, seedling (138) cdb1, seedling (137) cdpk-yfp1, seedling (65) cdpk-yfp4, seedling (65) chs, juvenile leaf (67) cir1-PR1-LUC, whole rosette (31) cir1-ein2-PR-LUC, whole rosette (31) cls8, seedling (76) cls8, seedling, 4°C (76) clv3, shoot apex (89) clv3, flower (89) cngc1, roots (141) cngc4, roots (141) co, apical region, vegetative (94) co, apical region, reproductive, 3d (94) co, apical region, reproductive, 5d (94) co, apical region, reproductive, 7d (94) coi1, senescing leaf (60) cov, stem, base (66) cov, stem, tip (66) det2, seedling, mock, 30min (111) det2, seedling, BL, 30min (111) det2, seedling, mock, 1h (111) det2, seedling, BL, 1h (111) det2, seedling, mock, 3h (111) det2, seedling, BL, 3h (111) det2, seedling (131) ein2, senescing leaf (60) ein2-PR1-LUC, whole rosette (31) etr1, whole plant, water (99) etr1, whole plant, GA4, 60 min (99) fls2, seedling, control (81) fls2, seedling, flg22 (81) ft, apical region, vegetative (94) ft, apical region, reproductive, 3d (94) ft, apical region, reproductive, 5d (94) ft, apical region, reproductive, 7d (94) fus, fresh seeds (96) ga1, seedling, mock, 30min (111) ga1, seedling, GA3, 30min (111) ga1, seedling, mock, 1h (111) ga1, seedling, GA3, 1h (111) ga1, seedling, mock, 3h (111) ga1, seedling, GA3, 3h (111) ga1, seedling (131) gl1, rosette leaf, stage 10 (88) gl1, rosette leaf, stage 12 (88) gpa1, seedling, ABA, 3h (75) gpa1, seedling (75) gun1-gun5, whole plant, Norflurazone (98) hic, guard cell enriched (11) hic, mature leaf (11) hic, guard cell enriched, CO2 (11) hic, mature leaf, CO2 (11) iae1, hypocotyl (139) iae2, hypocotyl (139) icl2 (Col), seedling (28) icl2 (Ws), seedling (28) ir1, roots (142) ku80, whole plant (57) ku80, whole plant, bleomycin, 3d (57) leafy-GR, seedling, de (143) leafy-GR, seedling, de/cyc (143) leafy-GR, seedling, cyc (143) lfy, shoot apex (89) lfy, flower (89) lfy, apical region, vegetative (94) lfy, apical region, reproductive, 3d (94) lfy, apical region, reproductive, 5d (94) lfy, apical region, reproductive, 7d (94) ms1-ttg, flower bud, old (9) ms1-ttg, flower bud, young (9) myb61, seedling (15) myb61, seedling, sucrose (15) MYB61o, seedling (15) MYB61o, seedling, sucrose (15) nahG, senescing leaf (60) o1, seedling (46) o1, seedling, H202, 3h (46) pasta2M1, mature leaf (150) pho1, mature leaf (61) pho3, leaf (27) pmr4, mature leaf, Erysiphe cichoracearum (85) pmr4, mature leaf (85) RALF1o, seedling (152) rbohB, seedling (59) rbohB, seedling, 30°C, 1h (59) rbohB, seedling, 40°C, 1h (59) rbohC, root, elongation zone (79) rdo, fresh seeds (96) rhd2, lateral roots (29) sfr2, whole rosette, 4°C (58) sfr2, whole rosette (58) sfr2-1, whole rosette, 4°C, 24h (12) sfr2-1, whole rosette, 4°C, 24h (12) sfr3, whole rosette, 4°C (58) sfr3, whole rosette (58) sfr6, whole rosette, 4°C (58) sfr6, whole rosette (58) sfr6, whole rosette, drought (58) sfr6, seedling (76) sfr6, seedling, 4°C (76) sfr6, suspension cell, light (153) sfr6, suspension cell, dark (153) sph1, leaves, stage 5 (145) sph1, leaves, stage 14 (145) tcp13, flowers (100) tcp14, flowers (100) ttg, flower bud, old (9) ttg, flower bud, young (9) ufo1, shoot apex (89) ufo1, flower (89) gun1-gun5, seedling, far red then white light (83) gun1-gun5, seedling, dark then white light (83) zorro, seedlings, control, 2h (103) zorro, seedlings, control 24h, (103) zorro, seedlings, zearalenone, 2h (103) zorro, seedlings, zearalenone, 24h (103) Locus Probeset Name Description Annotation score GO.keywords FunCat keywords AraCyc annotations KEGG annotations BioPath annotations AcylLipid category Literature annotations Gene family 90% quantile of DE max. DE
At5g09970 1.000 CYP78A7 cytochrome P450 family protein 0.31 0.26 0.34 -1.65 0.31 0.31 0.31 -1.52 -2.81 0.31 0.31 0.31 0.31 -0.7 -2.81 0.59 -2.81 0.12 -2.81 0.31 0.31 0.31 1.63 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.84 -2.81 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 -2.94 0.31 0.27 0.31 1.68 -2.56 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.96 0.31 0.31 -2.92 -1.79 -2.94 0.31 -2.29 -2.17 -1.74 -0.04 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 -1.73 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 -0.17 -2.81 -0.53 1.91 2.52 -1.53 0.31 2 -0.42 -0.88 -1.2 1.29 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 1.2 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 1.77 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.37 -2.81 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 0.31 At5g09970 250509_at CYP78A7 cytochrome P450 family protein 1




Fatty acid elongation and wax and cutin metabolism
cytochrome P450 family 3.98 5.45
At5g41890 0.599
GDSL-motif lipase/hydrolase family protein, similar to family II lipase EXL3, EXL1 , EXL2 (Arabidopsis thaliana) 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 -3.23 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 -0.71 0.12 -3.23 0.12 -3.23 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 -3.23 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 -3.23 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 3.51 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 -3.23 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 At5g41890 249277_at
GDSL-motif lipase/hydrolase family protein, similar to family II lipase EXL3, EXL1 , EXL2 (Arabidopsis thaliana) 2

triacylglycerol degradation




0.00 6.74
At1g02050 0.570
chalcone and stilbene synthase family protein 0.18 -0.4 0.06 -0.98 0.18 0.18 -0.9 -0.23 -4.62 0.18 0.18 0.18 0.18 -0.06 -1.06 1.06 -1.44 0.16 -4.25 0.18 0.18 0.45 0.2 0.18 0.18 0.93 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.4 -3.1 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 -0.27 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.56 0.18 0.18 0.18 0.18 0.02 0.51 -0.56 -0.16 -0.12 -0.35 -0.12 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.19 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 -0.19 -2.24 -0.36 0.84 -0.14 -0.26 2.47 1.85 0.54 -1.63 0.51 -0.62 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 0.5 -0.77 -1.54 0.18 0.22 -3.74 1.28 0.18 0.18 0.18 0.18 0.18 At1g02050 264175_at
chalcone and stilbene synthase family protein 2

fatty acid biosynthesis -- initial steps | flavonoid biosynthesis Flavonoid biosynthesis Phenylpropanoid Metabolism | Flavonoid and anthocyanin metabolism


1.92 7.09
At1g03390 0.544
transferase family protein, similar to anthranilate N-hydroxycinnamoyl/benzoyltransferase from Dianthus caryophyllus 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 -4.04 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 -1.95 0.16 -3.09 0.16 -4.04 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 -4.04 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 -2.39 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 -4.04 0.16 0.16 0.16 0.16 3.21 3.75 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 -1.86 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 1.26 0.16 -4.04 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 0.16 At1g03390 264827_at
transferase family protein, similar to anthranilate N-hydroxycinnamoyl/benzoyltransferase from Dianthus caryophyllus 1






acyltransferase, BAHD family, group D, HCT-like 2.09 7.79
At3g07450 0.533
protease inhibitor/seed storage/lipid transfer protein (LTP) family protein -0.14 0.26 0.26 0.26 0.09 -0.15 0.09 0.19 -5.21 0.09 0.09 0.7 0.09 0.53 -1.28 3.06 -1.48 0.19 -5.21 0.09 0.09 0.35 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.03 -5.5 0.09 0.39 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 -0.15 0.09 0.27 0.31 0.09 0.37 -0.37 0.09 0.09 0.09 0.47 0.09 0.09 0.09 0.09 0.57 0.09 0.45 0.26 0.09 -0.01 0.79 0.39 0.26 -0.44 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 1.63 0.09 1.9 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.69 0.09 0.09 0.19 -2.74 0.09 0.28 0.09 0.45 0.21 2.06 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.39 0.09 0.09 0.09 0.09 0.19 0.26 0.39 0.09 0.09 0.09 0.09 0.69 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 -0.16 0.09 0.09 0.56 -0.8 -0.41 0.81 0.21 -5.21 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 At3g07450 259063_at
protease inhibitor/seed storage/lipid transfer protein (LTP) family protein 2




Miscellaneous acyl lipid metabolism

1.44 8.56
At4g16270 0.526
peroxidase 40 (PER40) (P40) -0.4 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.25 -0.43 0.61 0.42 0.6 0.09 -1.79 -1.22 -0.11 -2.18 -0.05 -2.04 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 -0.18 -2.68 0.85 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.18 0.08 0.09 -0.28 -0.77 -0.46 0.09 0.12 0.09 0.09 0.09 0.09 -0.22 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.08 0.09 -0.05 -0.56 -0.46 0.47 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 1.46 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.39 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 -0.83 -2.11 0.09 0.09 0.09 0.09 -0.1 1.45 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 -0.65 0.09 0.09 -0.63 0.09 -0.66 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 3.07 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.09 0.11 -0.7 0.56 1.41 -0.92 -2.84 0.09 0.09 0.09 1.6 0.09 0.48 At4g16270 245488_at
peroxidase 40 (PER40) (P40) 2
detoxification
Methane metabolism | Prostaglandin and leukotriene metabolism | Phenylalanine metabolism | Stilbene, coumarine and lignin biosynthesis



1.50 5.90
At1g08065 0.522
carbonic anhydrase family protein 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -2.25 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.48 0.07 -0.3 0.07 -2.25 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.79 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.23 -0.06 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.73 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.06 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.22 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.54 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -2.25 0.07 0.07 -0.35 -0.55 -0.18 0.32 0.07 0.07 0.8 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 1.49 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.08 -0.81 0.39 0.64 0.07 -2.25 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 At1g08065 260621_at
carbonic anhydrase family protein 2

cyanate degradation




0.54 3.74
At1g01280 0.513 CYP703A2 cytochrome P450 family protein 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 -7.12 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 -0.46 0.21 -1.6 0.21 -7.12 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 -3.33 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 -0.38 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 -3.03 0.21 0.21 0.21 0.21 3.39 2.29 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 -2.97 0.1 0.21 -7.12 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 0.21 At1g01280 261051_at CYP703A2 cytochrome P450 family protein 1




Fatty acid elongation and wax and cutin metabolism
cytochrome P450 family 0.66 10.51
At4g32170 0.502 CYP96A2 cytochrome P450 family protein 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 -7.11 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 -0.64 3.36 -1.76 0.15 -7.11 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 -3.54 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 -0.12 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 1.22 0.15 0.15 0.11 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 3.65 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 -2.78 0.15 0.15 0.15 0.11 2.27 1.82 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 1.96 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 -1.12 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.13 -0.51 -1.76 0.32 0.15 -7.11 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 0.15 At4g32170 256297_at CYP96A2 cytochrome P450 family protein 1






cytochrome P450 family 1.20 10.76



































































































































































page created by Juergen Ehlting 04/24/06