Co-Expression Analysis of: CYP78A9 (At3g61880) Institut de Biologie Moléculaire des Plantes











































































































































_____________________________________________
____________________________________ ____________________________________ ____________________________________ ____________________________________ ____________________________________ ____________________________________ ____________________________________ ____________________________________

________________________ _____________________________________________ CYPedia Home






















































































































































Mutant Data Set save / view heatmap as: OpenOffice Table annotation details for co-expressed genes can be found to the right of the heatmap

























































































































































MS Excel Table

























































































































































save / view all data as: Tab delimited Table For further information on the experiments please go to the Genevestigator database using the experiment-ID given in brackets.






















































































































































shown are a maximum of 50 genes with r>0.5 (If more co-expressed genes with r>0.5 exist, they can be saved as Tab delimited data only) magnitude of change  [log2(mutant / wild type)]  0   0.3   0.6   0.9  1.2   1.5   1.8   2.1   2.4   2.7   >3















































































































































greater than zero                                                         



















































































































































less than zero                                                         



















































































































































Locus r-value Name Description 35S leafy, seedling (143) aba1, fresh seeds (96) abi1, fresh seeds (96) abi3, fresh seeds (96) acn1, seedlings (63) acn1, seedlings, with sucrose (63) add3, seedling (55) ag12, shoot apex (89) ag12, flower (89) akt1, roots (141) anr1, roots, dex treated, N03 depleted (64) anr1, roots, not dex treated, N03 depleted (64) anr1, roots, nitrate depleted (135) ap1, shoot apex (89) ap1, flower (89) ap2, shoot apex (89) ap2, flower (89) ap3, shoot apex (89) ap3, flower (89) ape2, mature leaf, high light (68) ape3, mature leaf, low light (68) ARR22o, seedling (115) ARR22o, seedling, zeatin (115) ar4, whole plant (104) bountifullo, juvenile leaf (48) camta1, suspension cell (138) camta1, seedling (138) cdb1, seedling (137) cdpk-yfp1, seedling (65) cdpk-yfp4, seedling (65) chs, juvenile leaf (67) cir1-PR1-LUC, whole rosette (31) cir1-ein2-PR-LUC, whole rosette (31) cls8, seedling (76) cls8, seedling, 4°C (76) clv3, shoot apex (89) clv3, flower (89) cngc1, roots (141) cngc4, roots (141) co, apical region, vegetative (94) co, apical region, reproductive, 3d (94) co, apical region, reproductive, 5d (94) co, apical region, reproductive, 7d (94) coi1, senescing leaf (60) cov, stem, base (66) cov, stem, tip (66) det2, seedling, mock, 30min (111) det2, seedling, BL, 30min (111) det2, seedling, mock, 1h (111) det2, seedling, BL, 1h (111) det2, seedling, mock, 3h (111) det2, seedling, BL, 3h (111) det2, seedling (131) ein2, senescing leaf (60) ein2-PR1-LUC, whole rosette (31) etr1, whole plant, water (99) etr1, whole plant, GA4, 60 min (99) fls2, seedling, control (81) fls2, seedling, flg22 (81) ft, apical region, vegetative (94) ft, apical region, reproductive, 3d (94) ft, apical region, reproductive, 5d (94) ft, apical region, reproductive, 7d (94) fus, fresh seeds (96) ga1, seedling, mock, 30min (111) ga1, seedling, GA3, 30min (111) ga1, seedling, mock, 1h (111) ga1, seedling, GA3, 1h (111) ga1, seedling, mock, 3h (111) ga1, seedling, GA3, 3h (111) ga1, seedling (131) gl1, rosette leaf, stage 10 (88) gl1, rosette leaf, stage 12 (88) gpa1, seedling, ABA, 3h (75) gpa1, seedling (75) gun1-gun5, whole plant, Norflurazone (98) hic, guard cell enriched (11) hic, mature leaf (11) hic, guard cell enriched, CO2 (11) hic, mature leaf, CO2 (11) iae1, hypocotyl (139) iae2, hypocotyl (139) icl2 (Col), seedling (28) icl2 (Ws), seedling (28) ir1, roots (142) ku80, whole plant (57) ku80, whole plant, bleomycin, 3d (57) leafy-GR, seedling, de (143) leafy-GR, seedling, de/cyc (143) leafy-GR, seedling, cyc (143) lfy, shoot apex (89) lfy, flower (89) lfy, apical region, vegetative (94) lfy, apical region, reproductive, 3d (94) lfy, apical region, reproductive, 5d (94) lfy, apical region, reproductive, 7d (94) ms1-ttg, flower bud, old (9) ms1-ttg, flower bud, young (9) myb61, seedling (15) myb61, seedling, sucrose (15) MYB61o, seedling (15) MYB61o, seedling, sucrose (15) nahG, senescing leaf (60) o1, seedling (46) o1, seedling, H202, 3h (46) pasta2M1, mature leaf (150) pho1, mature leaf (61) pho3, leaf (27) pmr4, mature leaf, Erysiphe cichoracearum (85) pmr4, mature leaf (85) RALF1o, seedling (152) rbohB, seedling (59) rbohB, seedling, 30°C, 1h (59) rbohB, seedling, 40°C, 1h (59) rbohC, root, elongation zone (79) rdo, fresh seeds (96) rhd2, lateral roots (29) sfr2, whole rosette, 4°C (58) sfr2, whole rosette (58) sfr2-1, whole rosette, 4°C, 24h (12) sfr2-1, whole rosette, 4°C, 24h (12) sfr3, whole rosette, 4°C (58) sfr3, whole rosette (58) sfr6, whole rosette, 4°C (58) sfr6, whole rosette (58) sfr6, whole rosette, drought (58) sfr6, seedling (76) sfr6, seedling, 4°C (76) sfr6, suspension cell, light (153) sfr6, suspension cell, dark (153) sph1, leaves, stage 5 (145) sph1, leaves, stage 14 (145) tcp13, flowers (100) tcp14, flowers (100) ttg, flower bud, old (9) ttg, flower bud, young (9) ufo1, shoot apex (89) ufo1, flower (89) gun1-gun5, seedling, far red then white light (83) gun1-gun5, seedling, dark then white light (83) zorro, seedlings, control, 2h (103) zorro, seedlings, control 24h, (103) zorro, seedlings, zearalenone, 2h (103) zorro, seedlings, zearalenone, 24h (103) Locus Probeset Name Description Annotation score GO.keywords FunCat keywords AraCyc annotations KEGG annotations BioPath annotations AcylLipid category Literature annotations Gene family 90% quantile of DE max. DE
At3g61880 1.000 CYP78A9 cytochrome P450 family protein. Overexpression of this gene allows fruit growth independently of fertilization. The gene is normally expressed only in floral organs, in the funiculus at anthesis. 0.04 0.01 -0.97 -0.97 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.06 -0.02 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 -1.64 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.33 0.55 0.41 0.12 -0.97 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 -1.47 0.04 0.77 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0 0.53 0.04 0.01 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 -0.01 0.04 0.94 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 -0.97 0.04 0.04 0.04 0.04 1.3 0.04 0.04 0.04 0.04 -2.17 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 -1.33 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 At3g61880 251301_at CYP78A9 cytochrome P450 family protein. Overexpression of this gene allows fruit growth independently of fertilization. The gene is normally expressed only in floral organs, in the funiculus at anthesis. 2.5 fruit development





cytochrome P450 family 0.94 3.47
At4g09080 0.624
similar to chloroplastic outer envelope membrane protein (OEP75) (Pisum sativum) 0.08 -1.54 -1.54 -1.54 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 1.21 1.95 1.95 1.78 -1.54 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 -0.84 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 -1.54 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 -8.76 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 At4g09080 255072_at
similar to chloroplastic outer envelope membrane protein (OEP75) (Pisum sativum) 4
protein targeting, sorting and translocation | transport routes | chloroplast transport | biogenesis of chloroplast

Chloroplastic protein import via envelope membrane | Toc apparatus


0.00 10.71
At3g60730 0.616
pectinesterase family protein 0.12 -1.24 -1.74 -3.74 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 -3.74 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.02 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 -6.6 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 0.12 At3g60730 251382_at
pectinesterase family protein 2
secondary metabolism | metabolism of primary metabolic sugars derivatives

Cell Wall Carbohydrate Metabolism | pectin metabolism


0.00 6.72
At5g66970 0.608
low similarity to Signal recognition particle 54 kDa protein 2 (SRP54) (Arabidopsis thaliana) 0.06 -1.06 -1.06 -1.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.5 0.06 0.06 0.06 -1.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 1.36 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 -1.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 -5.12 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 At5g66970 247016_at
low similarity to Signal recognition particle 54 kDa protein 2 (SRP54) (Arabidopsis thaliana) 2


Folding, Sorting and Degradation | Protein export



0.00 6.48
At3g12070 0.585
geranylgeranyl transferase type II beta subunit, putative / RAB geranylgeranyltransferase beta subunit, putative 0.07 0.13 0.27 -1.51 0.07 0.07 0.07 -0.38 -0.12 0.07 0.03 0.41 0.8 -0.03 0.08 -0.07 0.34 0.01 0.63 0.07 0.07 0.23 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.09 -0.38 0.07 0.8 0.07 0.07 0.07 0.07 1.17 -0.97 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.66 0.07 0.07 0.07 1.42 0.07 0.07 0.07 0.51 0.28 0.17 0.23 0.46 0.03 -1.51 0.07 0.07 0.07 -0.28 0.07 -0.54 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -1.08 -0.72 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.63 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.18 0.59 0.09 0.25 0.14 -0.19 -0.84 -0.8 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.93 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -1.51 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -3.17 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.84 -0.8 -0.59 -0.38 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 At3g12070 256276_at
geranylgeranyl transferase type II beta subunit, putative / RAB geranylgeranyltransferase beta subunit, putative 4


Glycan Biosynthesis and Metabolism | N-Glycan biosynthesis Isoprenoid Biosynthesis in the Cytosol and in Mitochondria | Protein prenylation
protein prenylation
1.41 4.59
At1g24735 0.572
Similar to caffeoyl-CoA 3-O-methyltransferase from Vitis vinifera and Medicago sativa 0.1 -0.86 -0.8 -3.09 0.1 -0.42 0.1 0.1 -0.06 0.1 -0.47 0.12 0.06 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 1.29 0.5 0.1 -0.93 0.1 0.1 -0.3 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.89 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.27 0.1 0.35 0.1 -2.98 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -0.52 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -0.11 0.1 0.1 -0.06 -0.06 -0.06 0.1 0.1 0.27 0.1 0.35 -0.68 0.1 0.1 1.01 0.83 -0.34 0.32 0.1 0.1 0.1 0.43 0.1 0.1 0.1 0.1 0.41 0.1 0.1 0.1 -0.22 -0.43 -0.06 0.61 -0.38 0.49 -0.22 -0.14 0.1 -0.07 0.1 -4.55 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -0.33 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 At1g24735 245650_at
Similar to caffeoyl-CoA 3-O-methyltransferase from Vitis vinifera and Medicago sativa 2

suberin biosynthesis | lignin biosynthesis


Phenylpropanoid pathway Methyltransferase, CCOMT like 0.94 5.84
At4g10490 0.569
oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein, similar to naringenin,2-oxoglutarate 3-dioxygenase (Dianthus caryophyllus), and to hyoscyamine 6 beta-hydroxylase (Atropa belladonna) 0.07 -0.74 -0.32 -1.1 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.05 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.14 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.93 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.08 0.07 0.07 -0.08 0.07 0.07 0.07 0.07 0.45 0.07 0.07 -0.79 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.06 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -0.04 0.45 -0.08 0.07 0.07 0.07 -0.21 0.07 -0.21 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.05 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 -5.39 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 At4g10490 254974_at
oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family protein, similar to naringenin,2-oxoglutarate 3-dioxygenase (Dianthus caryophyllus), and to hyoscyamine 6 beta-hydroxylase (Atropa belladonna) 2
biosynthesis of secondary products derived from primary amino acids | biosynthesis of glycosinolates and derivatives flavonoid biosynthesis
Phenylpropanoid Metabolism | Flavonoid and anthocyanin metabolism


0.27 5.84
At4g13280 0.547
terpene synthase/cyclase family protein 0.1 -2.22 -2.22 -2.22 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 2.48 -0.06 0.53 1.05 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -0.66 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 1.98 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -2.22 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -3.07 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 1.12 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -2.22 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -5.7 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 At4g13280 254766_at
terpene synthase/cyclase family protein 10





terpenoid metabolism | mono-/sesqui-/di-terpene biosynthesis | sequiterpene biosynthesis
0.67 8.18
At5g09640 0.544 SNG2 encodes a serine carboxypeptidase-like (SCPL) protein. Mutants accumulate sinapoylglucose instead of sinapoylcholine, and have increased levels of choline and decreased activity of the enzyme sinapoylglucose:choline sinapoyltransferase. 0.1 -1.07 -0.05 -1.72 -0.23 -0.06 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -0.52 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -0.52 0.1 0.1 -0.31 0.1 -0.27 0.1 -0.78 1.45 0.1 -0.52 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -1.3 -0.31 0.1 -0.27 0.1 -0.78 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.07 0.07 -0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -0.05 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -0.52 0.1 0.1 0.1 1.12 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -1.48 0.1 0.37 0.1 0.1 0.1 0.1 0.01 0.1 -0.18 -3.77 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -0.09 0.1 0.1 0.1 0.1 At5g09640 250501_at SNG2 encodes a serine carboxypeptidase-like (SCPL) protein. Mutants accumulate sinapoylglucose instead of sinapoylcholine, and have increased levels of choline and decreased activity of the enzyme sinapoylglucose:choline sinapoyltransferase. 7 sinapoyltransferase activity | secondary metabolism protein degradation




serine carboxy peptidase like, clade IA 0.63 5.22
At3g01850 0.541
strong similarity to D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase (Oryza sativa) -0.06 -0.41 -0.23 -1.26 0.04 0.08 -0.44 0.23 0.26 0.69 -0.02 -0.18 0.33 0.08 -0.07 0.1 0.37 0.25 0.16 0.09 0.19 -0.23 -0.02 0.41 -1.08 0.26 -0.01 0.11 0.46 0.31 0.01 0.07 0.07 0.35 0.07 -0.03 0.36 0.54 0.97 0.07 0.07 0.07 0.07 0.42 -0.44 -0.21 -0.59 0.08 1.06 1.14 -0.66 -0.65 0.28 0.5 0.07 0.51 0.51 -0.14 0.21 -0.13 0.38 0.2 0.28 -0.85 -0.59 -0.79 -0.32 -0.83 -0.66 -0.23 -0.26 0.28 -0.03 -0.31 -0.24 -0.15 -0.61 -0.66 0.07 0.07 0.09 0.48 0.07 0.07 -0.05 0.44 0.07 -0.11 -0.4 -0.6 0.18 0.19 -0.14 0.09 0.26 -0.15 0.23 -0.1 0.88 -0.21 0.17 -0.21 0.23 0.01 -0.16 0.23 0.41 0.09 0.15 0.5 0.19 -0.36 0 -0.17 -0.06 -0.49 0.07 0.53 1.39 0.07 0.07 0.36 -0.06 0.31 -0.13 -5.09 0.5 0.52 0.07 -0.07 0.21 -0.17 0.07 0.07 0.12 -0.3 0.22 0.31 0.56 0.57 -0.65 0.27 -0.91 -0.57 At3g01850 258999_at
strong similarity to D-ribulose-5-phosphate 3-epimerase (Oryza sativa) 6
C-compound and carbohydrate metabolism | pentose-phosphate pathway Calvin cycle | ribitol degradation | D-arabinose degradation II | non-oxidative branch of the pentose phosphate pathway
Intermediary Carbon Metabolism


1.22 6.49
At5g47810 0.538
similar to phosphofructokinase (Amycolatopsis methanolica) 0.06 -0.48 -0.05 -3.42 0.06 -0.15 0.06 -0.02 0.1 0.06 0.06 0.24 0.42 -0.05 0.36 -0.08 -0.28 0.18 -0.13 0.06 0.06 0.18 0.3 0.06 0.06 0.28 -0.48 -0.21 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0 -0.11 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 -0.08 0.43 0.71 0.26 0.11 0.06 0.1 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.14 -0.23 0.21 -0.07 -1.71 -0.25 0.06 0.06 -0.05 0.06 -0.1 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.02 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.28 0.06 0.06 0.01 -0.08 -0.18 0.06 0.06 0.06 -0.47 -0.19 -0.23 -0.25 -0.03 0.12 0.06 0.06 0.3 -0.04 0.37 0.91 0.06 0.06 0.06 0.06 0.31 0.06 0.06 0 0.06 0.06 0.06 0.06 0.31 -0.21 0.53 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 -4.3 0.06 0.06 0.06 0.09 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0.06 0 0.28 0.28 0.39 0.06 0.69 0.06 0.06 At5g47810 248722_at
similar to phosphofructokinase (Amycolatopsis methanolica) 2
C-compound and carbohydrate metabolism | glycolysis and gluconeogenesis mannitol degradation | sorbitol fermentation | sorbitol degradation | fructose degradation (anaerobic) | acetate fermentation | glycolysis I | glycolysis IV




0.62 5.21
At1g12960 0.537
Similar to 60S ribosomal protein L27A (RPL27aA) from Panax ginseng 0.05 -0.43 -0.19 -0.43 0.05 0.05 0.05 0.05 0.02 0.05 -0.2 -0.2 0.05 0.05 0.05 0.04 -0.08 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 -0.34 0.05 0.37 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 -0.43 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.36 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.69 0.66 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.72 0.05 0.15 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 -0.43 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 -6.69 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 0.05 At1g12960 261200_at
Similar to 60S ribosomal protein L27A (RPL27aA) from Panax ginseng 4


Ribosome



0.25 7.41
At4g27780 0.517 ACBP2 Encodes acyl-CoA-binding protein with ankyrin repeats -0.35 -0.07 -0.24 -1.25 0.1 0.08 0.05 -0.48 0.25 -0.4 0.28 0.1 0.11 0.31 0.03 0.2 0.01 0.26 0.41 0.04 0.03 -0.19 0.39 -0.13 -0.66 0.22 0.2 0.08 -0.14 -0.14 -0.06 0.03 0.03 0.17 0.06 0.28 0.49 0.03 -0.1 0.03 0.03 0.03 0.03 0.28 0.33 0.36 -0.12 0.03 -0.17 -0.33 -0.28 -0.16 0.35 0 0.03 0.28 -0.04 0.28 0.09 0.26 0.37 0.37 0.64 -1.22 0.03 0.63 0.38 0.15 0.16 0.24 -0.11 -0.21 -0.24 0.11 -0.1 -0.16 -0.5 -0.28 0.77 0.03 -0.24 -0.42 0.2 0.27 0.2 0.06 -0.31 -0.04 0.34 0.4 0.05 -0.06 -0.04 -0.21 -0.11 0.31 0.39 -0.42 0.11 -0.03 -0.14 -0.08 0.37 0.04 -0.39 -0.47 0.3 0.44 0.24 0.18 -0.2 0.09 -0.42 0.03 -0.25 0.59 -0.66 0.13 0.04 0.12 -0.06 0.13 0.19 0.15 0.02 -3.31 0.09 0.34 0.03 -0.37 0.01 -0.36 -0.21 -0.21 0.4 0.13 -0.06 0.17 0.05 0.16 -0.08 0.27 -0.03 -0.25 At4g27780 253840_at ACBP2 Encodes acyl-CoA-binding protein with ankyrin repeats 10 acyl-CoA binding | lipid transport



Miscellaneous acyl lipid metabolism

0.86 4.08
At1g06520 0.515
Encodes a membrane associated mitochrodrion loclaized protein with glycerol-3-phosphate acyltransferase activity.Expressed in flower buds and siliques. Homozygous mutant plants are male sterile and have abnormal glycerolipid levels. 0.1 -0.71 -0.46 -2.57 0.1 0.1 0.62 0.1 -1.54 -0.19 -0.75 -0.39 0.34 0.1 -0.07 0.3 0.48 -0.19 0.62 0.1 0.1 0.1 0.35 0.1 0.1 -0.08 0.52 0.1 0.1 0.49 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -0.36 0.91 -0.25 -0.01 0.1 0.1 0.1 0.1 0.93 0.1 0.07 0.16 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.81 0.1 0.32 -0.16 -0.3 0.1 -0.01 0.85 0.44 0.31 -2.33 0.16 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 -1.61 -1.87 0.1 0.1 -0.12 -0.12 0.1 0.1 0.1 -1.32 0.99 0.07 -0.32 -0.25 0.1 -2.31 0.22 0.2 0.01 -0.28 0.01 -1.05 1.19 0.1 0.1 0.1 1.54 0.1 1.01 0.1 0.1 0.1 0.1 0.13 -0.47 0.1 0.1 0.1 0.1 -0.87 0.1 0.1 0.28 0.1 0.1 0.1 0.08 0.1 -0.22 -3.9 0.1 0.1 0.1 0.1 0.1 0.36 0.56 0.7 0.07 -0.28 0.1 0.43 0.1 0.85 0.1 0.1 0.1 0.6 At1g06520 262630_at
Encodes a membrane associated mitochrodrion loclaized protein with glycerol-3-phosphate acyltransferase activity.Expressed in flower buds and siliques. Homozygous mutant plants are male sterile and have abnormal glycerolipid levels. 7 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity | male gamete generation (sensu Magnoliophyta)



metabolism of acyl-lipids in mitochondria

2.12 5.44
At1g28640 0.513
GDSL-motif lipase family protein 0.08 -1.35 -0.31 -4.33 0.08 0.08 0.08 0.08 -0.03 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.26 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 -0.03 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 -0.13 0.08 0.08 0.08 -0.01 0.13 0.1 -0.38 -1.58 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.15 -0.1 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 -0.04 0.08 0.26 0.13 0.08 0.08 0.08 0.08 1.72 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 -1.12 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 -2.73 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 0.08 At1g28640 262734_at
GDSL-motif lipase family protein 2

triacylglycerol degradation




0.20 6.04
At3g26040 0.510
transferase family protein, similar to deacetylvindoline 4-O-acetyltransferase (Catharanthus roseus), alcohol acyltransferase (Fragaria x ananassa) 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.09 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 -0.31 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 At3g26040 258070_at
transferase family protein, similar to deacetylvindoline 4-O-acetyltransferase (Catharanthus roseus), alcohol acyltransferase (Fragaria x ananassa) 1






acyltransferase, BAHD family, group C, DAT-SAAT-BEAT-SALAT-like 0.00 0.40
At4g39200 0.509 RPS25E 40S ribosomal protein S25 (RPS25E) -0.1 -1.79 -1.79 -1.79 -0.19 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 1.12 -0.2 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 -1.62 -1.93 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.57 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.85 -0.03 0.21 0.14 -1.79 0.14 0.14 0.14 0.73 0.14 0.14 0.14 0.14 0.19 -1.48 1.18 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 1.09 0.14 0.14 0.19 -1.52 0.14 0.14 0.14 0.14 -0.02 0.14 0.87 -0.03 0.21 0.01 -0.22 0.14 0.14 0.14 1.17 0.14 0.81 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 -1.79 0.14 0.14 0.14 -0.47 -0.47 0.14 0.14 0.14 0.14 -5.73 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 -1.89 0.23 -0.22 0.14 0.14 0.14 0.55 0.14 0.14 0.14 0.14 0.14 At4g39200 252912_at RPS25E 40S ribosomal protein S25 (RPS25E) 6
protein synthesis | ribosome biogenesis
Ribosome



2.48 6.91
At1g68270 0.508
AMP-dependent synthetase and ligase family protein, similar to AMP-binding protein (Brassica napus) 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.42 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 -1.73 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 At1g68270 260485_at
AMP-dependent synthetase and ligase family protein, similar to AMP-binding protein (Brassica napus) 2






Acyl activating enzymes , CoA ligases, clade VI 0.00 2.15
At5g10730 0.508
expressed protein -0.02 -0.56 -0.17 -1.06 -0.04 -0.07 0.25 0.08 0.08 -0.14 -0.1 -0.03 -0.17 0.11 0.17 0.11 0.43 0.03 0.11 0.08 -0.05 0.54 0.24 0.2 0.24 0.02 -0.02 -0.47 -0.22 -0.28 0 0.28 0.79 -0.01 -0.03 -0.05 0.68 0.03 -0.01 0 0 0 0 0.27 -0.01 -0.89 0.11 0.04 -0.23 -0.31 0 -0.16 0.07 0.2 0.17 0.28 0.01 0.03 0.06 -0.02 0.15 0.23 0.37 -0.76 0.5 0.44 0.5 0.37 0.42 0.28 0.17 0.01 0.14 -0.11 -0.18 -0.24 -0.15 0.23 0.62 0.02 0.03 0.21 -0.28 0.16 -0.05 0.08 0.28 0.15 -0.23 -0.19 -0.01 -0.02 -0.15 -0.08 -0.01 -0.04 -0.04 0.02 0.03 -0.02 -0.32 -0.03 0.37 0.06 -0.08 -0.24 0.51 0.27 -0.03 0.04 0.12 0.08 -0.11 0.07 0.01 0.03 -0.1 -0.05 -0.84 0.13 0.18 -0.05 -0.06 -0.14 0.16 -2.92 0.03 -0.03 0 0.17 -0.02 -0.28 -0.3 -0.38 0.68 0.28 0.12 0.08 -0.93 -0.23 -0.1 0.19 0.26 -0.06 At5g10730 246017_at
expressed protein 1

colanic acid building blocks biosynthesis | dTDP-rhamnose biosynthesis | galactose degradation I | UDP-glucose conversion | lactose degradation IV




0.95 3.72
At4g00500 0.506
lipase class 3 family protein / calmodulin-binding heat-shock protein-related 0.1 -0.46 -0.12 -0.56 0.02 0.02 0.02 0.15 0.24 0.02 -0.01 0.11 0.2 0.26 0.31 0.2 0.19 -0.07 0.64 0.02 0.02 0.56 0.32 0.02 0.02 -0.32 -0.04 -0.12 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.05 -0.11 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.82 -0.51 0.02 0.34 0.03 -0.42 -0.71 0.3 0.23 -0.03 0.47 0.02 0.03 0.02 0 0.21 -0.11 0.06 0.04 0 -0.21 0.07 -0.08 0.32 0.23 -0.18 -0.12 -0.12 -0.35 0.49 0.36 0.05 0.07 -0.11 -0.14 0.02 0.02 -0.25 -0.08 0.02 0.02 0.17 0.08 0.02 0.01 0.13 0.28 0.15 0.23 -0.46 0 -0.09 -0.37 0.12 -0.04 0.02 -0.19 0.02 -0.19 -0.32 0.02 0.02 -0.04 0.02 0.46 0.09 -0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 -0.26 -0.51 -0.52 -0.02 -0.36 0.32 0.02 0.26 -0.05 0.3 -0.03 -2.54 0.02 0.02 0.02 0.06 0.28 -0.09 0.02 0.02 -0.06 -0.08 -0.02 0.48 0.02 0.02 -0.16 -0.2 0.04 -0.12 At4g00500 255677_at
lipase class 3 family protein / calmodulin-binding heat-shock protein-related 2
stress response


Miscellaneous acyl lipid metabolism

0.81 3.37
At3g26160 0.504 CYP71B17 cytochrome P450 family protein 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.44 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.44 0.09 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.2 0.01 0.01 0.01 0.01 -2.66 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 At3g26160 257631_at (m) CYP71B17 cytochrome P450 family protein 1






cytochrome P450 family 0.00 3.10
At5g65550 0.503
UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase family protein; similar to flavonol 3-O-glucosyltransferase (anthocyanin rhamnosyl transferase) from Petunia hybrida -0.16 -0.32 -0.21 -2.2 -0.25 -0.06 0.01 0.05 0.16 -0.31 0 0.22 0 0 0.16 -0.12 0.16 0 -0.1 0.39 0.28 0.1 0.01 -0.35 0.11 0.2 0 -0.42 0.16 0.44 -0.28 0 0 0.57 -0.64 0 0.16 -0.1 -0.64 0 0 0 0 -0.2 -0.09 0.32 0.08 0.48 0 0 0 0 -0.08 -0.04 0.91 0.39 -0.38 0 0 0 0.26 0.1 -0.76 -1.93 -0.03 -0.04 0.1 0.14 0 0 -0.12 0.1 -0.18 -0.43 0.47 -0.02 -0.17 0 0.42 -0.53 0 0.3 -0.1 0.85 0.15 0.11 0 0.2 0.41 -0.16 -0.28 -0.09 0 0.26 -0.09 0 0.35 -0.28 0.8 0.15 0.49 0.26 0.24 -0.48 0.56 -0.04 -0.25 0.28 0.1 0.53 0 0 0.44 -0.04 -0.23 0.12 -0.11 0.14 -0.19 0.28 0.41 0.17 0 -0.08 0.17 -2.25 0 -0.02 0 0 -0.04 -0.18 0.91 1.49 0 -0.28 0 -0.05 -0.43 -0.14 0 0 -0.14 0 At5g65550 247172_at
UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase family protein; similar to flavonol 3-O-glucosyltransferase (anthocyanin rhamnosyl transferase) from Petunia hybrida 1






Glycosyl transferase, Family 1 1.00 3.75
At1g37150 0.502 HCS2.d holocarboxylase synthetase 2 (HCS2.d) 0.03 0.41 0.15 -1.77 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.81 0.3 0.03 0.77 0.77 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.51 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 1.57 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 -0.77 0.35 0.08 0.67 -0.7 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.08 1.06 0 -0.71 0.75 -0.35 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.15 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 -5.91 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 -2.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 At1g37150 265887_at (m) HCS2.d holocarboxylase synthetase 2 (HCS2.d) 6

fatty acid biosynthesis -- initial steps




0.49 7.47



































































































































































page created by Juergen Ehlting 04/24/06